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Science:CRISPR技術(shù)新應(yīng)用能快速鑒別基因變異

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關(guān)鍵詞:CRISPR技術(shù),基因編輯,Science

    CRISPR技術(shù)新應(yīng)用能快速鑒別基因變異

      由加州大學(xué)洛杉磯分校的Leonid Kruglyak領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)研究小組開(kāi)發(fā)出了一項(xiàng)新技術(shù),利用基因編輯系統(tǒng)CRISPR來(lái)快速鑒別基因變異。研究結(jié)果有可能顯著推動(dòng)繪制基因及確定它們功能的研究工作。相關(guān)論文發(fā)布在5月5日的《科學(xué)》(Science)雜志上。

      發(fā)現(xiàn)作為性狀變異基礎(chǔ)的DNA序列差異是現(xiàn)代遺傳學(xué)研究的一個(gè)中心目標(biāo)。當(dāng)前聯(lián)系基因型與表型的主要工具是連鎖與關(guān)聯(lián)研究。盡管連鎖與關(guān)聯(lián)研究已繪制出了促成表型變異的成千上萬(wàn)的基因組區(qū)域,要縮窄這些區(qū)域至潛在致病基因及變異則極具挑戰(zhàn)性。

      傳統(tǒng)上,發(fā)現(xiàn)基因變異一直局限于在低分辨率的自然發(fā)生減數(shù)分裂重組率下開(kāi)展研究工作,在減數(shù)分裂重組時(shí)細(xì)胞經(jīng)過(guò)兩次分裂生成生殖細(xì)胞,遺傳物質(zhì)被“重新洗牌”。通常,由于減數(shù)分裂重組率過(guò)低而無(wú)法解析單個(gè)基因的繪圖區(qū)域,更不要說(shuō)基因內(nèi)的特異變異。

      CRISPR技術(shù)新應(yīng)用能快速鑒別基因變異

      影響體細(xì)胞的有絲分裂重組可以讓我們更詳細(xì)地了解基因功能和變異,因?yàn)樗袝r(shí)候會(huì)導(dǎo)致形成具有一套基因(而非兩套基因)的重組染色體。這會(huì)使得一些基因喪失它們的功能,提供它們所起關(guān)鍵作用的一些重要見(jiàn)解。然而,有絲分裂重組是一種稀有事件。

      在這篇Science文章中Kruglyak和合著作者們指出,數(shù)十年來(lái)盡管繪圖研究已揭示出許多性狀的基因位點(diǎn),但鑒別潛在基因和變異卻一直滯后。他們開(kāi)發(fā)出了一種新型的CRISPR輔助的繪圖方法,有望消除這一缺口。他們的方法利用了CRISPR來(lái)生成密集覆蓋任意大小目的區(qū)域的定向重組事件。

      研究人員首先生成了CRISPR引導(dǎo)的、跨越一條酵母染色體臂的雜合性丟失(LOH)事件,利用生成的酵母菌株來(lái)繪制性狀變異。他們隨后讓一個(gè)QTL間區(qū)充滿重組事件快速鑒別出了在實(shí)驗(yàn)室釀酒酵母菌株中對(duì)錳(manganese)敏感性負(fù)責(zé)的一個(gè)因果關(guān)系的多態(tài)性。

      研究人員通過(guò)CRISPR輔助直接操控抗性等位基因進(jìn)入到一個(gè)敏感的酵母菌株中證實(shí)了這一多態(tài)性的因果作用。相比以往的策略,新方法生成了更高密度的重組事件,很容易可以靶向基因組的任何區(qū)域,其不需要額外費(fèi)時(shí)地生成雜交系統(tǒng)來(lái)提高重組頻率。

    (審核編輯: 滄海一土)

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